ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಜೊತೆಗೆ ಹಿಸ್ಟೋನ್ H2A ನ ಸಂಯೋಜನೆಯನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುವ ಮೂಲಕ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಅರಬಿಡೋಪ್ಸಿಸ್‌ನಲ್ಲಿ ಮಾಸ್ಟರ್ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ನಿಯಂತ್ರಕ DELLA ಅನ್ನು ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.

ಡೆಲ್ಲಾ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳು ಸಂರಕ್ಷಿತ ಮಾಸ್ಟರ್ ಆಗಿವೆ.ಬೆಳವಣಿಗೆ ನಿಯಂತ್ರಕಗಳುಆಂತರಿಕ ಮತ್ತು ಪರಿಸರ ಸೂಚನೆಗಳಿಗೆ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಯಾಗಿ ಸಸ್ಯ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವಲ್ಲಿ ಇದು ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರ ವಹಿಸುತ್ತದೆ. DELLA ಒಂದು ಪ್ರತಿಲೇಖನ ನಿಯಂತ್ರಕವಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅದರ GRAS ಡೊಮೇನ್ ಮೂಲಕ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಅಂಶಗಳು (TFs) ಮತ್ತು ಹಿಸ್ಟೋನ್ H2A ಗೆ ಬಂಧಿಸುವ ಮೂಲಕ ಗುರಿ ಪ್ರವರ್ತಕರಿಗೆ ನೇಮಕಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಇತ್ತೀಚಿನ ಅಧ್ಯಯನಗಳು DELLA ಸ್ಥಿರತೆಯನ್ನು ಎರಡು ಕಾರ್ಯವಿಧಾನಗಳ ಮೂಲಕ ಅನುವಾದದ ನಂತರ ನಿಯಂತ್ರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸಿವೆ: ಫೈಟೊಹಾರ್ಮೋನ್ ಗಿಬ್ಬೆರೆಲಿನ್‌ನಿಂದ ಪ್ರೇರಿತವಾದ ಪಾಲಿಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನೇಷನ್, ಇದು ಅದರ ತ್ವರಿತ ಅವನತಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಅದರ ಸಂಗ್ರಹವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸಲು ಸಣ್ಣ ಯುಬಿಕ್ವಿಟಿನ್-ತರಹದ ಮಾರ್ಪಾಡುಗಳ (SUMO) ಸಂಯೋಗ. ಇದರ ಜೊತೆಗೆ, DELLA ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಎರಡು ವಿಭಿನ್ನ ಗ್ಲೈಕೋಸೈಲೇಷನ್‌ಗಳಿಂದ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕವಾಗಿ ನಿಯಂತ್ರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ: DELLA-TF ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು O-ಫ್ಯೂಕೋಸೈಲೇಷನ್ ಮೂಲಕ ವರ್ಧಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ ಆದರೆ O-ಸಂಯೋಜಿತ N-ಅಸಿಟೈಲ್ಗ್ಲುಕೋಸಮೈನ್ (O-GlcNAc) ಮಾರ್ಪಾಡಿನಿಂದ ಪ್ರತಿಬಂಧಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, DELLA ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಪಾತ್ರವು ಅಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿಯೇ ಉಳಿದಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಹಿಂದಿನ ಅಧ್ಯಯನಗಳು DELLA ಅವನತಿಯನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುತ್ತದೆ ಅಥವಾ ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸುವ ಫಲಿತಾಂಶಗಳಿಂದ ಹಿಡಿದು ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಅದರ ಸ್ಥಿರತೆಯ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವುದಿಲ್ಲ ಎಂದು ತೋರಿಸುವ ಇತರ ಅಧ್ಯಯನಗಳವರೆಗೆ ಸಂಘರ್ಷದ ಫಲಿತಾಂಶಗಳನ್ನು ತೋರಿಸಿವೆ. ಇಲ್ಲಿ, ನಾವು REPRESSOR ನಲ್ಲಿ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಸೈಟ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತೇವೆ.ಗ್ಯಾ1-3(RGA, AtDELLA) ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಿಂದ ಅರಬಿಡೋಪ್ಸಿಸ್ ಥಾಲಿಯಾನಾದಿಂದ ಶುದ್ಧೀಕರಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ ಮತ್ತು PolyS ಮತ್ತು PolyS/T ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಎರಡು RGA ಪೆಪ್ಟೈಡ್‌ಗಳ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ H2A ಬೈಂಡಿಂಗ್ ಅನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು RGA ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ತೋರಿಸುತ್ತದೆ. ಗುರಿ ಪ್ರವರ್ತಕಗಳೊಂದಿಗೆ RGA ಸಂಯೋಜನೆ. ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ, ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ RGA-TF ಸಂವಹನಗಳು ಅಥವಾ RGA ಸ್ಥಿರತೆಯ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವುದಿಲ್ಲ. ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ DELLA ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುವ ಆಣ್ವಿಕ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ನಮ್ಮ ಅಧ್ಯಯನವು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ.
DELLA ಕಾರ್ಯವನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವಲ್ಲಿ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಪಾತ್ರವನ್ನು ಸ್ಪಷ್ಟಪಡಿಸಲು, DELLA ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಸೈಟ್‌ಗಳನ್ನು ಇನ್ ವಿವೋದಲ್ಲಿ ಗುರುತಿಸುವುದು ಮತ್ತು ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಕ್ರಿಯಾತ್ಮಕ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳನ್ನು ಮಾಡುವುದು ಬಹಳ ಮುಖ್ಯ. MS/MS ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ನಂತರ ಸಸ್ಯ ಸಾರಗಳ ಅಫಿನಿಟಿ ಶುದ್ಧೀಕರಣದ ಮೂಲಕ, ನಾವು RGA ನಲ್ಲಿ ಹಲವಾರು ಫಾಸ್ಫೋಸೈಟ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಿದ್ದೇವೆ. GA ಕೊರತೆಯ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ, RHA ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಹೆಚ್ಚಾಗುತ್ತದೆ, ಆದರೆ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಅದರ ಸ್ಥಿರತೆಯ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವುದಿಲ್ಲ. ಮುಖ್ಯವಾಗಿ, ಸಹ-IP ಮತ್ತು ChIP-qPCR ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು RGA ಯ PolyS/T ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ H2A ನೊಂದಿಗೆ ಅದರ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯನ್ನು ಮತ್ತು ಗುರಿ ಪ್ರವರ್ತಕರೊಂದಿಗೆ ಅದರ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುತ್ತದೆ ಎಂದು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸಿದೆ, ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ RGA ಕಾರ್ಯವನ್ನು ಪ್ರೇರೇಪಿಸುವ ಕಾರ್ಯವಿಧಾನವನ್ನು ಬಹಿರಂಗಪಡಿಸುತ್ತದೆ.
LHR1 ಸಬ್‌ಡೊಮೇನ್ ಮತ್ತು TF ನಡುವಿನ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಯ ಮೂಲಕ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್ ಅನ್ನು ಗುರಿಯಾಗಿಸಲು RGA ಅನ್ನು ನೇಮಿಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ನಂತರ ಅದರ ಪಾಲಿಸ್/ಟಿ ಪ್ರದೇಶ ಮತ್ತು PFYRE ಸಬ್‌ಡೊಮೇನ್ ಮೂಲಕ H2A ಗೆ ಬಂಧಿಸುತ್ತದೆ, RGA ಅನ್ನು ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸಲು H2A-RGA-TF ಸಂಕೀರ್ಣವನ್ನು ರೂಪಿಸುತ್ತದೆ. ಗುರುತಿಸಲಾಗದ ಕೈನೇಸ್ ಮೂಲಕ ಪಾಲಿಸ್/ಟಿ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿ ಪೆಪ್ 2 ನ ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ RGA-H2A ಬಂಧವನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ. rgam2A ರೂಪಾಂತರಿತ ಪ್ರೋಟೀನ್ RGA ಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಅನ್ನು ರದ್ದುಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು H2A ಬಂಧಕ್ಕೆ ಅಡ್ಡಿಪಡಿಸಲು ವಿಭಿನ್ನ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರೂಪಾಂತರವನ್ನು ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಇದು ಅಸ್ಥಿರ TF-rgam2A ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳ ಅಸ್ಥಿರತೆಗೆ ಮತ್ತು ಗುರಿ ಕ್ರೊಮಾಟಿನ್‌ನಿಂದ rgam2A ಯ ವಿಘಟನೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ. ಈ ಅಂಕಿ ಅಂಶವು RGA-ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆಯ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ದಮನವನ್ನು ಮಾತ್ರ ಚಿತ್ರಿಸುತ್ತದೆ. H2A-RGA-TF ಸಂಕೀರ್ಣವು ಗುರಿ ಜೀನ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಉತ್ತೇಜಿಸುತ್ತದೆ ಮತ್ತು rgam2A ಯ ಡಿಫಾಸ್ಫೊರಿಲೇಷನ್ ಪ್ರತಿಲೇಖನವನ್ನು ಕಡಿಮೆ ಮಾಡುತ್ತದೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಹೊರತುಪಡಿಸಿ, RGA-ಮಧ್ಯಸ್ಥಿಕೆಯ ಪ್ರತಿಲೇಖನ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುವಿಕೆಗೆ ಇದೇ ರೀತಿಯ ಮಾದರಿಯನ್ನು ವಿವರಿಸಬಹುದು. ಹುವಾಂಗ್ ಮತ್ತು ಇತರರು 21 ರಿಂದ ಚಿತ್ರ ಮಾರ್ಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ.
ಎಲ್ಲಾ ಪರಿಮಾಣಾತ್ಮಕ ದತ್ತಾಂಶಗಳನ್ನು ಎಕ್ಸೆಲ್ ಬಳಸಿ ಸಂಖ್ಯಾಶಾಸ್ತ್ರೀಯವಾಗಿ ವಿಶ್ಲೇಷಿಸಲಾಯಿತು ಮತ್ತು ವಿದ್ಯಾರ್ಥಿಗಳ ಟಿ ಪರೀಕ್ಷೆಯನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಗಮನಾರ್ಹ ವ್ಯತ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ನಿರ್ಧರಿಸಲಾಯಿತು. ಮಾದರಿ ಗಾತ್ರವನ್ನು ಪ್ರಾಥಮಿಕವಾಗಿ ನಿರ್ಧರಿಸಲು ಯಾವುದೇ ಸಂಖ್ಯಾಶಾಸ್ತ್ರೀಯ ವಿಧಾನಗಳನ್ನು ಬಳಸಲಾಗಿಲ್ಲ. ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯಿಂದ ಯಾವುದೇ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಹೊರಗಿಡಲಾಗಿಲ್ಲ; ಪ್ರಯೋಗವನ್ನು ಯಾದೃಚ್ಛಿಕಗೊಳಿಸಲಾಗಿಲ್ಲ; ಪ್ರಯೋಗದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ದತ್ತಾಂಶ ವಿತರಣೆ ಮತ್ತು ಫಲಿತಾಂಶಗಳ ಮೌಲ್ಯಮಾಪನಕ್ಕೆ ಸಂಶೋಧಕರು ಕುರುಡರಾಗಿರಲಿಲ್ಲ. ಮಾದರಿ ಗಾತ್ರವನ್ನು ಫಿಗರ್ ಲೆಜೆಂಡ್ ಮತ್ತು ಮೂಲ ದತ್ತಾಂಶ ಫೈಲ್‌ನಲ್ಲಿ ಸೂಚಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಅಧ್ಯಯನ ವಿನ್ಯಾಸದ ಕುರಿತು ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಾಹಿತಿಗಾಗಿ, ಈ ಲೇಖನಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದ ನೈಸರ್ಗಿಕ ಪೋರ್ಟ್‌ಫೋಲಿಯೋ ವರದಿ ಸಾರಾಂಶವನ್ನು ನೋಡಿ.
PXD046004 ಡೇಟಾಸೆಟ್ ಐಡೆಂಟಿಫೈಯರ್‌ನೊಂದಿಗೆ PRIDE66 ಪಾಲುದಾರ ರೆಪೊಸಿಟರಿಯ ಮೂಲಕ ಮಾಸ್ ಸ್ಪೆಕ್ಟ್ರೋಮೆಟ್ರಿ ಪ್ರೋಟಿಯೋಮಿಕ್ಸ್ ಡೇಟಾವನ್ನು ಪ್ರೋಟಿಯೋಮ್‌ಎಕ್ಸ್‌ಚೇಂಜ್ ಕನ್ಸೋರ್ಟಿಯಂಗೆ ಕೊಡುಗೆ ನೀಡಲಾಗಿದೆ. ಈ ಅಧ್ಯಯನದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಪಡೆದ ಎಲ್ಲಾ ಇತರ ಡೇಟಾವನ್ನು ಪೂರಕ ಮಾಹಿತಿ, ಪೂರಕ ದತ್ತಾಂಶ ಫೈಲ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಕಚ್ಚಾ ದತ್ತಾಂಶ ಫೈಲ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸಲಾಗಿದೆ. ಈ ಲೇಖನಕ್ಕಾಗಿ ಮೂಲ ದತ್ತಾಂಶವನ್ನು ಒದಗಿಸಲಾಗಿದೆ.